盐渍辣椒真菌多样性分析(二) Shannon指数小于盐渍米椒
2.3 盐渍米椒和线椒真菌多样性评估结果
优化序列在相似度97%的盐渍水平下进行OTU聚类,从表2可以看出,辣椒盐渍线椒和盐渍米椒的真菌真菌OTUs数分别为304个和18个,盐渍线椒中真菌的多样OTU数分别大于盐渍米椒真菌的OTU数;盐渍线椒和米椒真菌OUT值小于ACE值和Chao1值,说明在盐渍线椒和米椒中可能存在很多未知的性分析微生物资源;盐渍线椒细菌的ACE和Chaol指数大于盐渍米椒,Shannon指数小于盐渍米椒,盐渍Simpson大于盐渍米椒,辣椒说明盐渍线椒的真菌真菌丰富度(richness)大于盐渍米椒,盐渍米椒的多样真菌均衡度(Specieseveness)高于盐渍线椒。
2.4 盐渍线椒和米椒的性分析真菌群落多样性分析结果
2.4.1 盐渍线椒和米椒在门水平真菌群落组成
盐渍线椒和米椒的真菌18SrDNA基因经过焦磷酸测序和分类学分析后,在门分类水平,盐渍相对丰度大于0.01%的辣椒真菌见图2。盐渍线椒已知分类的真菌真菌可归属到2个门、13个纲、多样17个目、性分析31个科、45个属、87个种。盐渍米椒已知分类的真菌可归属到1个门、1个纲、2个目、2个科、2个属、1个种。其中盐渍线椒真菌门类(phylum)主要包括:子囊菌门(Ascomycota,73.63%)、担子菌门(Basidiomycota,23.42%),其它(Unclassified)占真菌序列总数的2.95%。盐渍米椒只有1个已知分类真菌门类:子囊菌门(Ascomycota,99.96%)。
2.4.2 盐渍线椒和米椒在纲水平真菌群落组成
在纲水平,盐渍线椒和盐渍米椒相对丰度大于0.01%的真菌见图3。从图3可以看出,在纲水平,盐渍线椒中相对丰度大于0.01%的真菌有酵母纲(Saccharomycetes,35.23%)、座囊菌纲(Dothideomycetes,29.78%)、银耳纲(Tremellomycetes,21.27%)、粪壳菌纲(Sordariomycetes,5.68%)、无分类(Unclassified5.22%)、柄锈菌亚门(Pucciniomycotina,1.72%)、锤舌菌纲(Leotiomycetes,0.43%)、伞型束梗孢菌纲(Agaricostilbomycetes,0.13%)、其它(Others,0.1%)、散囊菌纲(Eurotiomycetes,0.08%)、外担菌纲(Exobasidiomycetes,0.07%)、伞菌纲(Agaricomycetes,0.02%);盐渍线椒中相对丰度大于0.01%的真菌有酵母纲(Saccharomycetes,99.89%)、无分类(Unclassified,0.11%)。
2.4.3 盐渍线椒和米椒在目水平真菌群落组成
在目水平,盐渍线椒和盐渍米椒相对丰度大于0.01%的真菌见图4。从图4可以看出,在目水平,盐渍线椒中相对丰度大于0.01%的已知分类地位的真菌有酵母目(Saccharomycetales,35.23%)、格孢腔菌目(Pleosporales,22.82%)、银耳目(Tremellales,20.02%)、煤炱目(Capnodiales,6.75%)、小丛壳目(Glomerellales,5.15%)、担孢酵母目(Erythrobasidiales,1.58%)、线黑粉菌目(Filobasidiales,1.25%)、其它(Others,0.85%)、柔膜菌目(Helotiales,0.43%)、黑粉菌目(Agaricostilbomycetes_incertae_sedis,0.13%)、刺盾炱目(Chaetothyriales,0.08%)、锁掷酵母目(Sporidiobolales,0.08%);盐渍米椒中相对丰度大于0.01%的已知分类地位的真菌有酵母目(Saccharomycetales,99.89%)、无分类(Unclassified,0.11%)。
2.4.4 盐渍线椒和米椒在科水平真菌群落组成
在科水平,盐渍线椒和盐渍米椒相对丰度大于0.01%真菌见图5。在科水平,盐渍线椒中相对丰度大于0.01%的已知分类地位的真菌有毕赤酵母科(Pichiaceae,25.78%)、孢腔菌科(Pleosporaceae,22.23%)、有丝分裂银耳科(Mitosporic_Tremellales,18.15%)、有丝分裂酵母科(Mitosporic_Saccharomycetales,7.82%)、新球腔菌科(Davidiellaceae,6.27%)、未分类(Unclassified,5.42%)、其它(Others,4.72%)、小丛壳科(Glomerellaceae,4.4%)、银耳科(Tremellaceae,1.85%)、红担子科(Ery-throbasidiaceae,1.58%)、金丝酵母科(Debaryomycetaceae,0.95%)、酵母科(Saccharomycodaceae,0.15%)、有丝分裂伞型束梗孢菌亚纲(Mitosporic_Agaricostilbomycetidae,0.13%)、有丝分裂锁掷酵母科(Mitosporic_Sporidiobolales,0.08%);盐渍线椒中相对丰度大于0.01%的已知分类地位的真菌有有丝分裂锁掷酵母科(Mitosporic_Sporidiobolale,93.49%)、金丝酵母科(Debaryomycetaceae,0.06%)、无分类(Unclassified,6.09%)、其它(Others,0.37%)。
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